Hlízy topinamburu snadno vysychají a za běžných podmínek je
lze skladovat jen 2 - 4 týdny. Delší skladování je možné při zajištění vysoké relativní vlhkosti vzduchu, která se blíží 100%. Aby nedošlo k vyrůstání pupenů, doporučuje se skladovací teplota 2oC. Pokud by však k vyklíčení došlo, jsou výhonky, na rozdíl od klíčků brambor obsahujících solanin, nezávadné.