Častými chorobami řepy jsou spála řepná, virové žloutenky řepy – žloutenky BYV a mírné žloutnutí řepy – BMYV – snižují výnos i cukernatost v závislosti na době a stupni napadení. Z listových chorob houbového původu škodí skvrničnatka řepná (Cercospora beticola) a Padlí řepné (Erysiphe communis). K dalším chorobám patří plíseň řepná, skvrnatička řepná – cerkosporióza a rizománie.